W pierwszej kolejności trzeba wyjaśnić, że podatnikami VAT są osoby prawne, jednostki organizacyjne niemające osobowości prawnej oraz osoby fizyczne wykonujące samodzielnie działalność gospodarczą bez względu na cel lub rezultat takiej działalności (zob. art. 15 ust. 1 ustawy o VAT). Jednocześnie w art. 15 ust. 2 ustawy o VAT określona jest definicja działalności gospodarczej obowiązująca na gruncie VAT. Powoduje to, że podatnikami VAT mogą być również podmioty, które nie prowadzą działalności gospodarczej w rozumieniu innych przepisów (w szczególności przepisów ustawy o swobodzie działalności gospodarczej).
Walka KAS z wyłudzeniami VAT: Blokowanie rachunków bankowych może być groźne dla ich współwłaścicieli
Walka KAS z wyłudzeniami VAT: Blokowanie rachunków bankowych może być groźne dla ich współwłaścicieli

Zobacz również
Co do zasady, oddziały podatników nie są odrębnymi od central podatnikami VAT (np. wyrok Naczelnego Sądu Administracyjnego z 12 lutego 2014 r., sygn. akt I FSK 353/13). Wyjątek od tej zasady dotyczy jedynie – za zgodą naczelnika urzędu skarbowego – jednostek organizacyjnych osób prawnych, będących organizacjami pożytku publicznego prowadzących działalność gospodarczą, jeżeli samodzielnie sporządzają sprawozdanie finansowe (zob. art. 15 ust. 3b ustawy o VAT).
Z treści pytania nie wynika jednak, aby w przedstawionej sytuacji zgoda taka została uzyskana. Najprawdopodobniej zatem oddziały towarzystwa nie są odrębnymi (od towarzystwa podatnikami VAT – o odrębnym statusie oddziałów jako podatników VAT nie przesądza posiadanie własnych numerów NIP oraz REGON). Powoduje to, że usługa wykonana przez oddział na rzecz towarzystwa będzie usługą wykonaną wewnątrz tego samego podatnika. Czynność ta nie podlega zatem opodatkowaniu VAT, a w wyniku tego oddział nie musi z tytułu wykonania przedmiotowej usługi naliczać VAT.
Uszczelnianie podatków. Co już działa, co wejdzie w życie
Uszczelnianie podatków. Co już działa, co wejdzie w życie

Zobacz również
Dodać przy tym należy, że konsekwencją powyższej sytuacji (tj. braku odrębnego statusu oddziałów jako podatników) jest to, że sprzedaż wszystkich oddziałów towarzystwa jest z punktu widzenia VAT sprzedażą towarzystwa. Zapewne oznacza to, że towarzystwo już jakiś czas temu utraciło prawo do korzystania ze zwolnienia podmiotowego, tj. zwolnienia obejmującego sprzedaż dokonywaną przez podatników, u których wartość sprzedaży nie przekroczyła łącznie w poprzednim roku podatkowym kwoty 200 000 zł (zob. art. 113 ust. 1 ustawy o VAT). Oznaczałoby to, między innymi, że towarzystwo od dłuższego czasu powinno być zarejestrowane jako czynny podatnik VAT, zaś usługa, o której mowa, jest opodatkowana VAT.
Podstawa prawna
Art. 15 oraz art. 113 ust. 1 ustawy z 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (t.j. Dz.U. z 2017 r. poz. 1221 ze zm.).