Podatnik VAT, który w ciągu roku dokonuje zakupów związanych ze sprzedażą opodatkowaną i zwolnioną, może odliczyć tylko część VAT naliczonego. W przypadku gdy nie można wyodrębnić zakupów związanych ze sprzedażą zwolnioną oraz ze sprzedażą opodatkowaną, podatnik musi po roku dokonać ostatecznej korekty odliczonego podatku. Korekta będzie również niezbędna, od prawa wieczystego użytkowania, środków trwałych oraz wartości niematerialnych i prawnych oraz w razie likwidacji działalności i zmiany przeznaczenia towarów.
W zakresie, w jakim towary i usługi są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych, podatnikowi VAT przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego. Kwotę podatku naliczonego stanowi:
• suma kwot podatku określonych w fakturach otrzymanych przez podatnika: z tytułu nabycia towarów i usług, potwierdzających dokonanie przedpłaty (zaliczki, zadatku, raty), jeżeli wiązały się one z powstaniem obowiązku podatkowego, od komitenta z tytułu dostawy towarów będącej przedmiotem umowy komisu, z uwzględnieniem rabatów,
• w przypadku importu towarów - suma kwot podatku wynikająca z dokumentu celnego i deklaracji importowej,
• zryczałtowany zwrot podatku przekazany przez podatnika dla rolników ryczałtowych,
• kwota podatku należnego od importu usług, kwota podatku należnego od dostawy towarów, dla której podatnikiem jest ich nabywca, oraz kwota podatku należnego z tytułu wewnątrzwspólnotowego nabycia towarów,
• kwota podatku należnego z tytułu importu towarów objętych procedurą uproszczoną.
Jednak w specyficznych przypadkach określonych w ustawie o VAT należy skorygować wcześniej odliczony podatek.