Projekt ustawy o fundacji rodzinnej ma regulować również kwestie opodatkowania całego cyklu jej funkcjonowania, m.in. wnoszenia do niej aktywów i wypłat na rzecz beneficjentów
- wnoszenie majątku do fundacji będzie neutralne podatkowo,
- jeżeli wypłata dla beneficjentów pochodziłaby z dywidend od spółek, którymi zarządza fundacja, to sama dywidenda wypłacona fundacji byłaby zwolniona z podatku dochodowego, ale już wypłata tych środków beneficjentom byłaby opodatkowana 19-proc. podatkiem dochodowym,
- beneficjenci musieliby zapłacić 19-proc. PIT również w sytuacji, gdy otrzymane od fundacji pieniądze pochodziłyby ze sprzedaży udziałów lub akcji w posiadanych przez nią spółkach,
- inne wypłaty z fundacji na rzecz niektórych beneficjentów (np. dzieci fundatora) ponad wartość wkładów fundatora byłyby opodatkowane podatkiem od spadków i darowizn,
- jeśli dopuszczona zostanie możliwość prowadzenia działalności gospodarczej przez fundację, to jej dochody z tego tytułu mają być opodatkowane 19-proc. CIT.